高美湿地虽然面积不大，但是由于泥质及沙质滩地兼具，加上与河口沼泽地带镶嵌在一起，所以孕育了丰富又复杂的湿地生态，以及目前所知全台湾族群的云林莞草区，生态种类亦相当复杂，主要为鸟类、鱼类、蟹类及其它无脊椎类等生物。
高美自行车道
高美自行车道规划“河滨生态解说园”、“灯塔博物馆”、“生态展售区”、“服务设施区”、“生态解说体验园”、“滨海生态学习园区”、“电力博物馆”等设施，让游客可以沿途欣赏优美的风景，另外还能可以高美湿地能有更深入的了解。
高美自行车是沿着清水大排、海堤至高美湿地，南起滨海桥、北至高美海堤防汛道路，全长1.7公里，车道旁紧邻清水大排和高美湿地，除了可以鸟瞰整片高美湿地外，同时也是赏鸟、看夕阳的好地方。
